মাদারগঞ্জ উপজেলায় ৫টি এতিমখানা আছে। এইসব এতিমখানাগুলো সরকারি ও বেসরকারিভাবে পরিচালিত হয়ে থাকে। এই সকল এতিমখানায় সাধারনত পিতা-মাতাহীন শিশুদের থাকতে দেখা যায়। সরকারি বিভিন্ন অনুষ্ঠান (যেমনঃ জাতীয় শিশু দিবস) এইসব এতিমদেরকে ভাল মানের খাবার পরিবেশনের ব্যবস্থা থাকে।
১। মোমেনাবাদ এতিমখানা
২। নলসিয়া মদিনাতুল উলুম এতিমখানা
৩। নুরানী সমাজকল্যান এতিমখানা
৪। খাজা শাহসুফী ইউনুস আলী এতিমখানা
৫। উত্তর চরবলা ঈদগামাঠ এতিমখানা
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস